MODALIDAD ASINCRÓNICA
¡Inscríbete en cualquier momento y accede inmediatamente al material del curso!
El curso incluye acceso a un Foro Comunitario donde podrá dejar sus consultas sobre el contenido o la instalación del software.
La respuesta a consultas se maneja por demanda y no en tiempo real, con un tiempo de respuesta de 24 a 48 horas hábiles.
- Las prácticas deben ser realizadas en el equipo propio del participante.
- Instalación de Programas y Solución: El participante es responsable de la correcta instalación del software de acceso libre. Proveeremos los enlaces oficiales a las guías de instalación del programa.
- ¡Recomendación Clave: Entorno Estándar! Recomendamos fuertemente el uso de contenedores (Docker/Singularity). Le proporcionaremos el script del contenedor pre-seteado para minimizar los problemas y asegurar que el entorno de trabajo sea funcional rápidamente.
- Recuerde: La asistencia a problemas específicos de instalación en su sistema operativo solo se brinda en nuestros Cursos Sincrónicos, donde garantizamos el acceso a nuestro servidor.
- Para asegurar que tu experiencia de aprendizaje sea fluida, te recomendamos revisar la sección de REQUISITOS PREVIOS (Técnicos y de Conocimiento) que encontrarás descrita más abajo.
¿Necesita la solución al instante y funcionalidad garantizada?
Si requiere resolución de preguntas al instante por parte del instructor, y acceso inmediato a un servidor de trabajo con todos los programas previamente instalados (eliminando su necesidad de RAM y el riesgo de instalación), le invitamos a matricularse en nuestros Cursos Sincrónicos.
Garantía Total de 72 Horas: El alumno tiene 72 horas para solicitar el reembolso, contando desde el momento de la matrícula.
Límite de Consumo de Contenido: El reembolso solo aplica si el alumno ha consumido menos del 20% del contenido del curso.
MODALIDAD SINCRÓNICA
Únete a nuestro curso modalidad sincrónica y participa en sesiones en vivo con nuestros expertos. Necesitamos un mínimo de 15 alumnos para abrir el curso y brindarte esta experiencia única.
¡Inscríbete ahora y asegura tu lugar en el curso! No dejes pasar esta oportunidad única de mejorar tus habilidades bioinformáticas.
Del 06 – 10 de Octubre
- Lunes
- Martes
- Miércoles
- Jueves
- Viernes
- 16 – 18 hrs Mex
- 17 – 19 hrs Per, Col, Ecu
- 19 – 21 hrs Arg, Chi
- 00 – 02 hrs Esp, Ale
- Interacción en tiempo real con los instructores.
- Resolución instantánea de preguntas y dudas.
- Networking con profesionales y estudiantes del sector.
- Descuentos con fechas limitadas.
BioScience-App Instituto Latinoamericano de Bioinformática y Biotecnología (BILBB) garantiza la correcta ejecución de los cursos ofrecidos. Sin embargo, se reserva el derecho de cancelar o reprogramar un curso en caso de fuerza mayor, causas logísticas o cualquier circunstancia que impida su realización conforme a lo previsto.
En caso de cancelación definitiva del curso, BioScience-App procederá al reembolso del 100% del monto abonado por concepto de inscripción, dentro de un plazo máximo de 10 días hábiles. El participante no asumirá costo adicional alguno y quedará libre de compromisos posteriores.
La inscripción implica la aceptación de estas condiciones.
Inscripciones ABIERTAS
Análisis de Expresión Diferencial de Genes
La transcriptómica ha contribuido a la identificación de nuevas dianas terapéuticas y la identificación de biomarcadores novedosos de enfermedades. El uso de RNA-Seq se ha convertido en una herramienta esencial para la identificación de perfiles genéticos asociados a determinadas patologías y la comprensión de la regulación de la expresión génica. Sin embargo, este tipo de tecnologías generan datos masivos que no sólo requieren de herramientas análiticas específicas sino también de profesionales capaces de analizarlos e interpretarlos.
INFORMACIÓN DEL CURSO:
- Nivel: Introductorio
- Duración: +10 horas
- Online y a tu ritmo
- 07 tópicos de aprendizaje
- Certificado
- Grupo privado de alumnos
Analizaremos una línea celular tumoral
En este curso cubriremos el proceso completo desde la descarga de datos crudos de secuenciación hasta la identificación y el análisis de enriquecimiento de genes diferencialmente expresados. Nos centraremos principalmente en el análisis de células de neuroblastoma, una línea celular tumoral, sometida a tratamientos con dos agentes farmacológicos distintos que influyen en la regulación del ciclo celular.
¿Qué aprenderás en este curso?
Accederás a turoriales de expertos para llavar tus habilildades de análisis de expresión diferencial de genes al siguiente nivel
1.
Los fundamentos teóricos del RNA-Seq
2.
El manejo de los paquetes de R y programas de linux especializados para este tipo de análisis
3.
Cómo realizar por tu cuenta el análisis de expresión diferencial de genes
4.
La creación de gráficos típicos de estos análisis (heatmaps, volcano plots, análisis de enriquecimiento en KEGG y GO)
5.
La lectura y escritura de códigos base para trabajar en tus propios análisis
TEMARIO COMPLETO
Plan de estudio
26 lecciones
en
5 módulos
- Fundamentación teórica de tecnología de secuenciación de última generación
- Descripción general del método de secuenciación por síntesis.
- Workflow para la obtención final de número de lecturas asignada a cada gen.
Repositorios públicos: de dónde bajar y a dónde subir datos.
- Manejo de funciones básicas.
- Definición de
variables. - Descripción de los distintos tipos
de objetos (vectores, matrices, data frame). - Utilización de funciones de ayuda de R.
- Recomendaciones para escritura de scripts.
- Descarga de un dataset de trabajo de neuroblastoma desde GEO.
- Análisis de control de calidad de las
secuenciación en R usando fastqcr.
Presentación de MultiQC. - Trimming de las secuencias.
- Descarga del genoma de referencia.
- Descarga del index del genoma.
- Alineamiento de las secuencias al genoma de referencia. PARTE 1.
- obtención
de la tabla de cuentas de genes.
- Alineamiento al genoma de referencia: Descarga del genoma de referencia, descarga del index del genoma, alineamiento de las secuencias y obtención de la tabla de cuentas de genes. PARTE 2.
- Análisis de expresión diferencial entre dos condiciones.
- Gráfica de Volcano plot.
- Gráfica de Heatmap.
- Enriquecimiento Ontológico (GO)
- Obtención de la vías metabólicas.
- Obtención de funciones celulares enriquecidas.
- Presentación de gProfiler.
- Gráfico de vías metabólicas de KEGG.
- Gráfica de GO.
- Presentación de la consigna del trabajo final
Modalidad del curso
Cursos teórico-práctico a tu ritmo
Video-tutoriales y otros recursos
Aprenderás +10 horas de video tutoriales grabados, lecturas, plantillas y ejercicios.
Acceso inmediato e ilimitado
Las clases no tienen vencimiento. Podrás cursar a tu ritmo y sin límites.
Soporte de especialistas
Nuestro equipo te ayudará a poner en práctica las lecciones.
Certificado
Podrás obtener un certificado de participación a tu nombre.
Requisitos previos
- Los participantes deben tener conocimientos básicos sobre cómo trabajar con herramientas de línea de comandos en sistemas basados en Unix.
- No es necesario tener conocimientos en el desarrollo de script.
- Es deseable la familiaridad con los conceptos de biología molecular.
- Estar familiarizado con los conceptos básicos de bioinformática, en especial análisis de secuencias.
Sesiones Sincrónicas:
- Los participantes deberán disponer de sus propios ordenadores con sistema operativo Linux, Windows o iOS.
- Conexión a Internet.
- Memoria RAM mínima de 4GB.
Sesiones Asincrónicas:
- Los participantes deberán disponer de sus propios ordenadores.
Configuración Recomendada:
- Tener previamente instalado el programa Docker.
Conexión a Internet. - Memoria RAM: 32GB o más.
- Procesador: Intel Core i9 (o equivalente en AMD) con seis núcleos o más.
- Almacenamiento: 100GB SSD con alta velocidad de lectura/escritura.
- Sistema Operativo: Preferiblemente Linux; alternativamente Windows 10/11 o macOS
Sobre los programas a usar:
1. Clases sincrónicas: Harán uso del servidor de BILBB donde ya se tiene los programas previamente instalados.
2. Clases asincrónicas: Se tendrá dos opciones.
- Instalar los programas que se van a requerir localmente en su propio ordenador. En la plataforma Classroom encontrará un contenedor docker con los programas a usar, además de tener que instalar el programa R y RStudio e instalar las librerías necesarias (La lista de librerías las encontrará en la plataforma Classroom)
- Solicitar el uso del servidor BILBB donde ya se tiene previamente instalado los programas necesarios para desarrollar el curso (Esta segunda opción tiene un cargo adicional y previa coordinación de horario de uso)
Preguntas
Frecuentes
Sí, te sugerimos revisar los requisitos previos para poder llevar el curso. La información lo encuentras justo arriba de esta sección.
El contenido del curso está en formato de lecturas y videos tutoriales.
Las clases sincrónicas se realizarán a través de Google Meet.
Todo el material de las clases tanto para la modalidad sincrónica y asincrónica estarán en la plataforma Classroom.
Sí, puedes abonar online con PayPal en dólares seleccionando el ícono de “USD” en tu carrito.
NO, el pago es único. Una vez que compres el curso tendrás acceso a él por 6 meses o hasta una actualización del curso.
Modalidad sincrónica: Tendrá que participar en al menos el 80% de las sesiones para obtener un certificado de participación respaldado por BILBB.
Modalidad asincrónica: Tendrá que dar una evaluación, si responde correctamente hasta un 80% de las preguntas se le enviará un certificado de participación respaldado por BILBB.
Modalidad sincrónica: Tiene una duración de 05 días. Sin embargo, las grabaciones de las clases estarán disponibles por 06 meses.
Modalidad asincrónica: El curso tiene un aproximado de 10 horas de video. Por lo que depende de la velocidad en la que quieras avanzar. Tendrás disponible las grabaciones y todo el material por 06 meses.
Revisar los requisitos técnicos que se encuentra justo en la sección anterior de preguntas frecuentes.
Modalidad sincrónica: El curso comienza y termina en las fechas previamente programadas.
Modalidad asincrónica: El contenido del curso ya está cargado para que lo veas cuando quieras. Puedes hacerlo las veces que quieras y a tu tiempo. Podrás ingresar al curso desde tu casa, oficina o cualquier lugar en el que tengas conexión a internet, las 24 horas del día.
Por una cuestión de derechos al autor no podrás descargar los vídeos, pero siempre podrás acceder a las lecciones desde cualquier dispositivo con conexión a Internet.
Te acompañaremos en casa paso del proceso a través de:
- La plataforma Classroom, donde pordrás escribirnos las dudas que tengas.
- Podrás revisar las consultas de tus compañeros y las respuestas que iremos colgando en la plataforma Classroom.
Una vez que hayas agregado el curso a tu carrito podrás elegir como pagarlo en dólares.
Dólares: El curso se paga una única vez a través de PayPal con tarjeta o dinero en cuenta.
Si te encuentras en Perú, podrás realizar el pago en efectivo en el banco InterBank, se te enviará el número de cuenta para que te puedas acercarte a una agencia bancaria.
Una vez que realices el pago se creará tu cuenta en BILBB, te llegará la contraseña a tu correo y podrás acceder inmediatamente a todas las lecciones desde tu cuenta.
El curso es online y con soporte. Podrás ver el contenido cuando lo desees y consultar dudas por la plataforma Classroom de donde te encuentres.
Tenemos dos modalidades:
- Sincrónico
- Asincrónico
Modalidad sincrónica: NÓ, podrás acceder al servidor de BILBB donde ya se tiene previamente configurado los programas bioinformáticos para que puedas desarrollar el curso sin ningún contratiempo. Solo tienes que tener acceso a internet y un computador sin tanto recurso computacional.
Modalidad asincrónica: SÍ, previamente necesitarás instalar los programas que se usarán. En la plataforma Classroom tendrás un contenedor docker para que puedas instalar los programas necesarios para el curso. Te recomendamos revisar los requisitos técnicos que se muestran en la sección anterior (Antes de preguntas frecuentes).
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