MODALIDAD ASINCRÓNICA
¡Inscríbete en cualquier momento y accede inmediatamente al material del curso!
El curso incluye acceso a un Foro Comunitario donde podrá dejar sus consultas sobre el contenido o la instalación del software.
La respuesta a consultas se maneja por demanda y no en tiempo real, con un tiempo de respuesta de 24 a 48 horas hábiles.
- Las prácticas deben ser realizadas en el equipo propio del participante.
- Instalación de Programas y Solución: El participante es responsable de la correcta instalación del software de acceso libre. Proveeremos los enlaces oficiales a las guías de instalación del programa.
- ¡Recomendación Clave: Entorno Estándar! Recomendamos fuertemente el uso de contenedores (Docker/Singularity). Le proporcionaremos el script del contenedor pre-seteado para minimizar los problemas y asegurar que el entorno de trabajo sea funcional rápidamente.
- Recuerde: La asistencia a problemas específicos de instalación en su sistema operativo solo se brinda en nuestros Cursos Sincrónicos, donde garantizamos el acceso a nuestro servidor.
- Para asegurar que tu experiencia de aprendizaje sea fluida, te recomendamos revisar la sección de REQUISITOS PREVIOS (Técnicos y de Conocimiento) que encontrarás descrita más abajo.
¿Necesita la solución al instante y funcionalidad garantizada?
Si requiere resolución de preguntas al instante por parte del instructor, y acceso inmediato a un servidor de trabajo con todos los programas previamente instalados (eliminando su necesidad de RAM y el riesgo de instalación), le invitamos a matricularse en nuestros Cursos Sincrónicos.
Garantía Total de 72 Horas: El alumno tiene 72 horas para solicitar el reembolso, contando desde el momento de la matrícula.
Límite de Consumo de Contenido: El reembolso solo aplica si el alumno ha consumido menos del 20% del contenido del curso.
MODALIDAD SINCRÓNICA
Únete a nuestro curso modalidad sincrónica y participa en sesiones en vivo con nuestros expertos. En esta oportunidad las clases se llevarán a cabo independientemente del número de inscritos, así que aún tienes tiempo para inscribirte. ¡Quedan pocos días!.
¡Inscríbete ahora y asegura tu lugar en el curso! No dejes pasar esta oportunidad única de mejorar tus habilidades bioinformáticas.
Del 18 – 22 de Agosto
- Lunes 18
- Martes 19
- Miércoles 20
- Jueves 21
- Viernes 22
- 09 – 11 hrs Mex
- 10 – 12 hrs Per, Col, Ecu
- 12 – 14 hrs Arg, Chi
- 17 – 19 hrs Esp, Ale
- Interacción en tiempo real con los instructores.
- Resolución instantánea de preguntas y dudas.
- Networking con profesionales y estudiantes del sector.
- 30% OFF! Válido hasta el 03 de agosto.
BioScience-App Instituto Latinoamericano de Bioinformática y Biotecnología (BILBB) garantiza la correcta ejecución de los cursos ofrecidos. Sin embargo, se reserva el derecho de cancelar o reprogramar un curso en caso de fuerza mayor, causas logísticas o cualquier circunstancia que impida su realización conforme a lo previsto.
En caso de cancelación definitiva del curso, BioScience-App procederá al reembolso del 100% del monto abonado por concepto de inscripción, dentro de un plazo máximo de 10 días hábiles. El participante no asumirá costo adicional alguno y quedará libre de compromisos posteriores.
La inscripción implica la aceptación de estas condiciones.
Inscripciones CERRADAS
Análisis Bioinformático en Metagenómica WGS
El análisis bioinformático metagenómico es crucial hoy en día, ya que permite explorar la diversidad microbiana en diferentes entornos sin necesidad de cultivo. Esto facilita la identificación de patógenos, el estudio de resistencias antimicrobianas y la comprensión de los ecosistemas microbianos, impactando positivamente en la salud humana, la agricultura y el medio ambiente.
INFORMACIÓN DEL CURSO:
- Nivel: Introductorio
- Duración: +10 horas
- Online y a tu ritmo
- 07 tópicos de aprendizaje
- Certificado
- Grupo privado de alumnos
Analizaremos muestras de suelo
Realizaremos un análisis exhaustivo de dos tipos de suelos utilizados para el cultivo de frutas. El primer suelo ha sido utilizado durante aproximadamente 20 años con la aplicación continua de fertilizantes. En estos cultivos, se ha observado una creciente incidencia de ataques por patógenos y parásitos. Se sospecha que el uso excesivo de fertilizantes ha provocado una disbiosis, afectando negativamente la microbiota del suelo y causando una mayor compactación y dureza del mismo.
Por otro lado, se comparará este suelo enfermo con un suelo sano o virgen, donde se han iniciado recientemente los cultivos de la misma fruta. Este suelo no ha mostrado problemas de infestación por parásitos o patógenos, lo que sugiere una microbiota del suelo más equilibrada y saludable.
¿Qué aprenderás en este curso?
Accederás a turoriales de expertos para llavar tus habilildades de análisis de datos metagenómicos WGS al siguiente nivel
1.
Bases teóricas sobre el análisis bioinformático con datos metagenómicos – shotgun sequencing
2.
Análisis de Calidad de secuencias metagenómicas
3.
Limpieza de secuencias metagenómicas
4.
Ensamble de metagenomas con diferentes herramientas bioinformáticas
5.
Anotación de ensambles metagenómicos.
Clasificación taxonómica
6.
Comparación de clasificaciones taxonómicas
TEMARIO COMPLETO
Plan de estudio
22 lecciones
en
5 módulos
- Fundamentación teórica de tecnología de secuenciación de última generación
- Archivos de secuenciación.
- Tipos de ensambladores metagenómicos.
- Workflow para el análisis de muestras metagenómicas.
- Estrategias para el ensamble.
- Descarga de un dataset de trabajo.
- Análisis de control de calidad de la
secuenciación – Parte 1. metagenómica.
- Análisis de control de calidad de la secuenciación metagenómica – Parte 2.
- Limpieza de lecturas usando trimgalore.
- Limpieza de lecturas usando trimmomatic.
- Ensamble de metagenomas usando MEGAHIT.
- Ensamble de metagenomas usando METASPADES.
- Ensamble de metagenomas usando IDBA_UD.
- Comparación de los ensambles.
- Predicción de genes de los metagenomas ensamblados.
- Alineamiento del ensamble metagenómico.
- Clasificación Taxonómica (METAPHLAN2).
- Clasificación taxonómica usando KRAKEN (Basado en contigs).
- Clasificación taxonómica usando KRAKEN (Basado en lecturas).
- Clasificación Taxonómica usando KAIJU (Basado en lecturas).
- Generación del reporte con KAIJU2Table
- Visualización de las taxonomías.
Modalidad del curso
Cursos teórico-práctico a tu ritmo
Video-tutoriales y otros recursos
Aprenderás +8 horas de video tutoriales grabados, lecturas y ejercicios.
Acceso inmediato e ilimitado
Las clases no tienen vencimiento. Podrás cursar a tu ritmo y sin límites.
Soporte de especialistas
Nuestro equipo te ayudará a poner en práctica las lecciones.
Certificado
Podrás obtener un certificado de participación a tu nombre.
Requisitos previos
- Los participantes deben tener conocimientos básicos sobre cómo trabajar con herramientas de línea de comandos en sistemas basados en Unix.
- No es necesario tener conocimientos en el desarrollo de script.
- Es deseable la familiaridad con los conceptos de biología molecular.
- Estar familiarizado con los conceptos básicos de bioinformática, en especial análisis de secuencias.
Clases Sincrónicas:
- Los participantes deberán disponer de sus propios ordenadores con sistema operativo Linux, Windows o iOS.
- Conexión a Internet.
- Memoria RAM mínima de 4GB.
Clases Asincrónicas:
Los participantes deberán disponer de sus propios ordenadores.
Configuración Recomendada:
- Tener previamente instalado el programa Docker.
- Conexión a Internet.
- Memoria RAM: 32GB o más.
- Procesador: Intel Core i9 (o equivalente en AMD) con seis núcleos o más.
- Almacenamiento: 300GB SSD con alta velocidad de lectura/escritura.
- Sistema Operativo: Preferiblemente Linux; alternativamente Windows 10/11 o macOS
Sobre los programas a usar:
Clases sincrónicas: Harán uso del servidor de BILBB donde ya se tiene los programas previamente instalados.
Clases asincrónicas: Se tendrá dos opciones.
- Instalar los programas que se van a requerir localmente en su propio ordenador. En la plataforma Classroom encontrará un contenedor docker con los programas a usar.
- Solicitar el uso del servidor BILBB donde ya se tiene previamente instalado los programas necesarios para desarrollar el curso (Esta segunda opción tiene un cargo adicional y previa coordinación de horario de uso).
Preguntas
Frecuentes
Sí, te sugerimos revisar los requisitos previos para poder llevar el curso. La información lo encuentras justo arriba de esta sección.
El contenido del curso está en formato de lecturas y videos tutoriales.
Las clases sincrónicas se realizarán a través de Google Meet.
Todo el material de las clases tanto para la modalidad sincrónica y asincrónica estarán en la plataforma Classroom.
Sí, puedes abonar online con PayPal en dólares seleccionando el ícono de “USD” en tu carrito.
NO, el pago es único. Una vez que compres el curso tendrás acceso a él por 6 meses o hasta una actualización del curso.
Modalidad sincrónica: Tendrá que participar en al menos el 80% de las sesiones para obtener un certificado de participación respaldado por BILBB.
Modalidad asincrónica: Tendrá que dar una evaluación, si responde correctamente hasta un 80% de las preguntas se le enviará un certificado de participación respaldado por BILBB.
Modalidad sincrónica: Tiene una duración de 05 días. Sin embargo, las grabaciones de las clases estarán disponibles por 06 meses.
Modalidad asincrónica: El curso tiene un aproximado de 10 horas de video. Por lo que depende de la velocidad en la que quieras avanzar. Tendrás disponible las grabaciones y todo el material por 06 meses.
Revisar los requisitos técnicos que se encuentra justo en la sección anterior de preguntas frecuentes.
Modalidad sincrónica: El curso comienza y termina en las fechas previamente programadas.
Modalidad asincrónica: El contenido del curso ya está cargado para que lo veas cuando quieras. Puedes hacerlo las veces que quieras y a tu tiempo. Podrás ingresar al curso desde tu casa, oficina o cualquier lugar en el que tengas conexión a internet, las 24 horas del día.
Por una cuestión de derechos al autor no podrás descargar los vídeos, pero siempre podrás acceder a las lecciones desde cualquier dispositivo con conexión a Internet.
Te acompañaremos en casa paso del proceso a través de:
- La plataforma Classroom, donde pordrás escribirnos las dudas que tengas.
- Podrás revisar las consultas de tus compañeros y las respuestas que iremos colgando en la plataforma Classroom.
Una vez que hayas agregado el curso a tu carrito podrás elegir como pagarlo en dólares.
Dólares: El curso se paga una única vez a través de PayPal con tarjeta o dinero en cuenta.
Si te encuentras en Perú, podrás realizar el pago en efectivo en el banco InterBank, se te enviará el número de cuenta para que te puedas acercarte a una agencia bancaria.
Una vez que realices el pago se creará tu cuenta en BILBB, te llegará la contraseña a tu correo y podrás acceder inmediatamente a todas las lecciones desde tu cuenta.
El curso es online y con soporte. Podrás ver el contenido cuando lo desees y consultar dudas por la plataforma Classroom de donde te encuentres.
Tenemos dos modalidades:
- Sincrónico
- Asincrónico
Modalidad sincrónica: NÓ, podrás acceder al servidor de BILBB donde ya se tiene previamente configurado los programas bioinformáticos para que puedas desarrollar el curso sin ningún contratiempo. Solo tienes que tener acceso a internet y un computador sin tanto recurso computacional.
Modalidad asincrónica: SÍ, previamente necesitarás instalar los programas que se usarán. En la plataforma Classroom tendrás un contenedor docker para que puedas instalar los programas necesarios para el curso. Te recomendamos revisar los requisitos técnicos que se muestran en la sección anterior (Antes de preguntas frecuentes).
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