MODALIDAD ASINCRÓNICA
¡Inscríbete ahora y accede inmediatamente al material del Gym!
MODALIDAD SINCRÓNICA
Para que el curso en modalidad sincrónica se lleve a cabo y puedas disfrutar de una experiencia en tiempo real con el instructor. Necesitamos un mínimo de 15 alumnos para abrir el curso y brindarte esta experiencia única..
¡Inscríbete ahora y asegúrate de que el curso se aperture!
Por Definir
- Lunes
- Miércoles
- Viernes
- 16 – 18 hrs Mex
- 17 – 19 hrs Per, Col, Ecu
- 19 – 21 hrs Arg, Chi
- 00 – 02 hrs Esp, Ale
- Interacción en tiempo real con los instructores.
- Resolución instantánea de preguntas y dudas.
- Networking con profesionales y estudiantes del sector.
- 20% de descuento para los primeros 10 inscritos.
BioScience-App Instituto Latinoamericano de Bioinformática y Biotecnología (BILBB) garantiza la correcta ejecución de los gimnasios bioinformáticos ofrecidos. Sin embargo, se reserva el derecho de cancelar o reprogramar un curso en caso de fuerza mayor, causas logísticas o cualquier circunstancia que impida su realización conforme a lo previsto.
En caso de cancelación definitiva del curso, BILBB procederá al reembolso del 100% del monto abonado por concepto de inscripción, dentro de un plazo máximo de 10 días hábiles. El participante no asumirá costo adicional alguno y quedará libre de compromisos posteriores.
La inscripción implica la aceptación de estas condiciones.
Inscripciones CERRADAS
Gym | Modelamiento Molecular de Proteínas
Mejora tus habilidades bioinformáticas con ejercicios y desafíos bioinformáticos en el modelamiento molecular de proteínas usando herramientas de inteligencia artificial (IA).
En este gimnasio de bioinformática estructural, desarrollarás habilidades clave en el análisis, modelamiento y diseño de estructuras moleculares, enfrentando desafíos reales de relevancia biomédica. A través de ejercicios prácticos, aplicarás herramientas modernas de predicción estructural, ensamblaje de complejos y diseño asistido por inteligencia artificial para estudiar interacciones proteína-proteína, regiones desordenadas y estrategias terapéuticas frente a la resistencia bacteriana.
INFORMACIÓN DEL CURSO:
- Nivel: Introductorio
- Duración: +24 Hrs guiadas
- Duración: +48 Hrs ejercicios
- Online y a tu ritmo
- 07 tópicos de aprendizaje
- Certificado
- Grupo privado de alumnos
Realizaremos cuatro retos prácticos de alto impacto biológico
¿Qué aprenderás en este Gym?
Accederás a tutoriales de expertos para llavar tus habilildades de análisis en el modelamiento molecular de proteínas
TEMARIO COMPLETO
Plan del Gym
12 módulos
Ejercicio 1 - Ensamblaje de un filamento formado por septinas de Aedes aegypti
Duración: 3 Sesiones
- Día y fecha referencial a sesiones sincrónicas
- Lunes 19 Ago
- Miércoles 21 Ago
- Viernes 23 Ago
Objetivo: Se estudiarán septinas de Aedes aegypti, proteínas filamentosas importantes en el proceso de división celular. Realizaremos la predicción de las estructuras de las diferentes subunidades que forman el complejo oligomérico. Así mismo, usando la versión multimer, montaremos el filamento hexamerico y evaluaremos las interfaces de contacto de las subunidades.
- Buscar las secuencias de septinas pertenecientes a la especie.
- Clasificar dentro de los grupos de septinas referencias funcional.
- Realizar la predicción por ColabFold v1.5.2-patch para las septinas individuales.
- Realizar complejos diméricos.
Realizar un complejo trimérico.
- Evaluar las interfaces de contacto y sus energías por PISA.
- Describir las características de los modelos.
Ejercicio 2 - Determinar la interface de contacto entre la proteína Fibra del adenovirus tipos VII y su receptor o diana CD46
Duración: 3 Sesiones
- Día y fecha referencial a sesiones sincrónicas
- Lunes 26 Ago
- Miércoles 28 Ago
- Viernes 30 Ago
Objetivo: Realizaremos la predicción de la estructura de la proteína Fibra del adenovirus tipo VII, además de su receptor CD46. Se evaluará el plegamiento de la proteína y se realizará una descripción de las estructuras. Además, detectaremos la interfaz de contacto en el complejo formado por ambas proteínas (lo que permitiría describir el mecanismo de reconocimiento de la proteína-receptor).
- Buscar las secuencias de las proteínas.
- Identificar potenciales sitios activos y de unión con servidores online.
- Realizar la predicción de un complejo homotrimérico por ColabFold v1.5.2-patch para la proteína fibra de adenovirus tipo VII.
- Realizar la predicción del receptor CD46.
- Predecir el complejo proteína-receptor por ColabFold v1.5.2-patch o Cosmic2.
- De no identificar un complejo, usar docking proteína-proteína.
- Evaluar las interfaces de contacto y sus energías por PISA.
- Describir las características de los modelos.
Ejercicio 3 - Estudio de regiones intrínsecamente desordenadas en proteínas
Duración: 3 Sesiones
- Día y fecha referencial a sesiones sincrónicas
- Lunes 02 Set
- Miércoles 04 Set
- Viernes 06 Set
Objetivo: Analizaremos las regiones IDR de la proteína 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, relacionada con la pre-biogenesis de la subunidad 60S del ribosoma humano. Además, evaluaremos su interacción con el factor de activación Nip7 humano
- Buscar las secuencias de las proteínas CysMet y Nip7.
- Realizar la predicción de IDR en CysMet.
- Realizar la predicción de la estructura de CysMet por ColabFold v1.5.2-patch.
- Realizar la predicción del complejo entre CysMet-Nip7 por ColabFold v1.5.2-patch.
- Evaluar las interfaces de contacto y la calidad de la predicción de los modelos.
Ejercicio 4 - Diseño de un péptido para unión a la proteína Beta-lactamase NDM-1 de Klebsiella pneumoniae relacionada con la resistencia bacteriana
Duración: 3 Sesiones
- Día y fecha referencial a sesiones sincrónicas
- Lunes 09 Set
- Miércoles 11 Set
- Viernes 13 Set
Objetivo: Utilizaremos la herramienta RFdiffusion-Colab para diseñar un péptido que bloquee el sitio activo de la proteína Beta-lactamase NDM-1 de Klebsiella pneumoniae (E9NWK5_KLEPN), una proteína relacionada con el mecanismo de resistencia a antibióticos
- Hacer un reconocimiento del notebook RFdifussion-colab.
- Predicción de una secuencia aleatoria
- Usando la opción binder design.
- Usando la opción de múltiples segmentos.
- Usando All o partial diffusion.
Modalidad del curso
Cursos teórico-práctico a tu ritmo
Video-tutoriales y otros recursos
Aprenderás +24 horas de video tutoriales grabados, lecturas, plantillas y ejercicios.
Acceso inmediato e ilimitado
Las clases no tienen vencimiento. Podrás cursar a tu ritmo y sin límites.
Soporte de especialistas
Nuestro equipo te ayudará a poner en práctica las lecciones.
Certificado
Podrás obtener un certificado de participación a tu nombre.
Requisitos previos
- Se recomienda que tengan conocimiento en:
- AlphaFold, nociones básicas
- Pfam
- PyMOL u otro visualizador
- Uniprot
- NCBI
- PDB
- Es deseable la familiaridad con los conceptos bioinformáticos en el análisis estructural de proteínas.
- No es necesario tener conocimiento en el desarrollo de script.
- Estar familiarizado con los conceptos básicos de bioinformática, en especial análisis de secuencias de aminoácidos.
- Estar familiarizado con los conceptos básicos de bioinformática, en especial análisis de secuencias.
Sesiones Sincrónicas/Asincrónicas:
- Los participantes deberán disponer de sus propios ordenadores con sistema operativo Linux, Windows o iOS.
- Conexión a Internet.
- Memoria RAM mínima de 4GB.
Preguntas
Frecuentes
Sí, te sugerimos revisar los requisitos previos para poder llevar el Gym. La información lo encuentras justo arriba de esta sección.
El contenido del Gym está en formato de lecturas y videos tutoriales.
Las clases sincrónicas se realizarán a través de Google Meet.
Todo el material de las clases tanto para la modalidad sincrónica y asincrónica estarán en la plataforma Classroom.
Sí, puedes abonar online con PayPal en dólares seleccionando el ícono de “USD” en tu carrito.
NO, el pago es único. Una vez que compres el Gym tendrás acceso a él por 6 meses o hasta una actualización del curso.
Modalidad sincrónica: Para obtener un certificado de participación respaldado por BILBB, se requiere la participación en al menos el 80% de las sesiones. Ofrecemos dos tipos de certificados:
- Certificado por 24hrs: Otorgado a aquellos que participen en todas las sesiones guiadas pero no completen los ejercicios asignados por el instructor.
- Certificado por 48hrs: Otorgado a aquellos que participen en al menos el 80% de las sesiones guiadas y entreguen los ejercicios resueltos asignados por el instructor.
Modalidad asincrónica: Para obtener un certificado de participación respaldado por BILBB, se requiere aprobar una evaluación, respondiendo correctamente al menos el 80% de las preguntas.
Solo se ofrece un tipo de certificado:
- Certificado por 24hrs: Otorgado a aquellos que completen todas las sesiones guiadas y que aprueben la evaluación.
Modalidad sincrónica: Tiene una duración de 04 semanas. Sin embargo, las grabaciones de las sesiones estarán disponibles por 06 meses.
El Gym tiene un aproximado de 24 horas de sesiones guiadas y 24 horas adicionales en las podrán acceder al servidor BILBB para que puedan resolver los ejercicios que deje el instructor.
Modalidad asincrónica: El gym tiene un aproximado de 24 horas de video. Por lo que depende de la velocidad en la que quieras avanzar. Tendrás disponible las grabaciones y todo el material por 06 meses.
Revisar los requisitos técnicos que se encuentra justo en la sección anterior de preguntas frecuentes.
Modalidad sincrónica: El Gym comienza y termina en las fechas previamente programadas.
Modalidad asincrónica: El contenido del Gym estará cargado en la fecha previamente programada para que lo veas cuando quieras. Puedes hacerlo las veces que quieras y a tu tiempo. Podrás ingresar al curso desde tu casa, oficina o cualquier lugar en el que tengas conexión a internet, las 24 horas del día.
Por una cuestión de derechos al autor no podrás descargar los vídeos, pero siempre podrás acceder a las lecciones desde cualquier dispositivo con conexión a Internet.
Te acompañaremos en casa paso del proceso a través de:
- La plataforma Classroom, donde pordrás escribirnos las dudas que tengas.
- Podrás revisar las consultas de tus compañeros y las respuestas que iremos colgando en la plataforma Classroom.
Una vez que hayas agregado el curso a tu carrito podrás elegir como pagarlo en dólares.
Dólares: El curso se paga una única vez a través de PayPal con tarjeta o dinero en cuenta.
Si te encuentras en Perú, podrás realizar el pago en efectivo en el banco InterBank, se te enviará el número de cuenta para que te puedas acercarte a una agencia bancaria.
Una vez que realices el pago se creará tu cuenta en BILBB, te llegará la contraseña a tu correo y podrás acceder inmediatamente a todas las lecciones desde tu cuenta.
El Gym es online y con soporte. Podrás ver el contenido cuando lo desees y consultar dudas por la plataforma Classroom de donde te encuentres.
Tenemos dos modalidades:
- Sincrónico
- Asincrónico
En ambos casos se tendrá 24 horas de ejercicios guiados y un tiempo de 24 horas para que cada participante pueda desarrollar los ejercicios adicionales que el instructor dejará como retos a desarrollar.
Modalidad sincrónica: NÓ, podrás acceder al servidor de BILBB donde ya se tiene previamente configurado los programas bioinformáticos para que puedas desarrollar el curso sin ningún contratiempo. Solo tienes que tener acceso a internet y un computador sin tanto recurso computacional.
Modalidad asincrónica: SÍ, previamente necesitarás instalar los programas que se usarán. En la plataforma Classroom tendrás un contenedor docker para que puedas instalar los programas necesarios para el curso. Te recomendamos revisar los requisitos técnicos que se muestran en la sección anterior (Antes de preguntas frecuentes).
MODALIDAD ASINCRÓNICA
¡Inscríbete ahora y accede inmediatamente al material del curso!
MODALIDAD ASINCRÓNICA
¡Inscríbete ahora y accede inmediatamente al material del curso!
Valoraciones
No hay valoraciones aún.